毕业论文查重率与学术合作的关系密切，一方面，学术合作可以提高毕业论文的质量，从而降低了查重率；另一方面，毕业论文查重率是学术合作的重要指标之一。在学术合作中，合作双方需要共同努力，提高毕业论文的质量，降低查重率。具体来说，可以通过合作指导、共同研究等方式提高毕业论文的质量，从而降低查重率。

提高毕业论文查重率的方法有很多，可以从以下几个方面入手：1.认真审题，遵守学术规范，避免抄袭；2.引用文献时要规范，避免出现格式错误；3.修改论文时要认真，避免出现语法错误和拼写错误；4.使用专业的查重软件，及时发现和修改论文中的问题。总之，提高毕业论文查重率需要认真对待每一个环节，从而保证论文的质量和学术合作的顺利进行。